LncRNA 測序

技術(shù)簡介

長鏈非編碼RNA (long non-coding RNA) 是一類長度大于 200nt，且不編碼蛋白質(zhì)的 RNA，廣泛存在于生物體內(nèi)。Lnc-RNA 測序采用去除 rRNA 的建庫方法，并依托高通量測序技術(shù)，一次性獲得單堿基分辨率的特定組織或細(xì)胞在特定階段的所有 mRNA 和lncRNA，研究 lncRNA 在轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等方面對基因表達(dá)的調(diào)控作用。

技術(shù)路線

送樣建議

技術(shù)參數(shù)

案例分析

Lnc RNA 表達(dá)譜揭示腸道組織微生物群的分子特征^[1]

研究背景            

腸道微生物群可以影響宿主的生理、代謝、營養(yǎng)和免疫力而被稱為隱藏的器官。腸道微生物群的形成主要由于環(huán)境和基因效應(yīng)的作用，以前的研究焦點(diǎn)在于編碼蛋白的基因，而長鏈非編碼與腸道微生物群之間的聯(lián)系很少有報道。

研究目的

通過外顯子芯片技術(shù)和 Lnc RNA 表達(dá)譜技術(shù)探索腸道微生物群形成過程中 Lnc RNA 表達(dá)之間的關(guān)系。

研究結(jié)果

成功鑒定出傳統(tǒng)小鼠和無菌小鼠之間 Lnc RNA 表達(dá)差異，研究證明在腸道中的不同的微生物群其 Lnc RNA 表達(dá)譜不一樣。

圖1.共生的微生物群,大腸桿菌(大腸桿菌),或大腸桿菌表達(dá)膽汁鹽水解酶(E.coli-BSH)調(diào)節(jié)的 lncRNAs圖譜以及傳統(tǒng)和無菌小鼠之間LncRNA差異表達(dá)

參考文獻(xiàn)

[1]. Liang, L. et al. Long noncoding RNA expression profiles in gut tissues constitute molecular signatures that reflect the types of microbes. Sci Rep, 2015, 5:11763, doi:10.1038/srep11763.